1）昆蟲、雜草檢疫重點實驗室所配置用于形態學鑒定的顯微鏡包括光學顯微鏡、掃描電鏡（必要時配置）這一關鍵儀器要求達到國際一流水平。
（2）植物病原真菌和線蟲檢疫重點實驗室所配置的用于形態學鑒定的顯微鏡，包括光學顯微鏡和掃描電鏡（必要時配置）；用于病原物培養的光照培養箱；用于致病性測定的人工氣候箱；用于病原菌保存的超低溫冰箱或菌種保存箱；和用于分子生物學檢測的PCR儀、定量PCR儀、芯片掃描檢測儀等關鍵儀器設備要求達到國際一流水平。
（3）植物病毒檢疫重點實驗室所配置的用于植物病毒提取的高速離心機、超速離心機；用于病毒形態學觀察的透射電鏡（必要時配置）；用于血清學檢測的酶標儀、洗板機和用于分子生物學檢測的主要儀器設備：PCR儀、定量PCR儀、芯片掃描儀等關鍵儀器設備要求達到國際一流水平。
（4）植物病原細菌檢疫重點實驗室所配置的用于病原物分離培養的光照培養箱或人工氣候箱；用于病原菌保存的冰箱、超低溫冰箱或菌種保存箱；用于細菌生化檢測的微生物自動分析儀和用于分子生物學檢測的PCR儀、定量PCR儀、芯片掃描檢測儀等關鍵儀器設備均要求達到國際一流水平。
（5）轉基因產品檢測重點實驗室所配置的用于分子生物學檢測的關鍵儀器設備：PCR儀、定量PCR儀、基因芯片掃描儀、紫外分光光度計等要求達到國際一流水平。
（6）檢疫處理重點實驗室所配置的用于物理處理、化學處理等關鍵儀器：要求達到國際一流水平。
（7）按照產品進行分類的重點實驗室和隔離檢疫重點實驗室該類實驗室包括：玉米、豆類、麥類、林木、花卉、煙草、蔬菜種子、種苗、水果、草坪種子等實驗室以及隔離實驗室，該類實驗室檢測的有害生物復雜，有的包括幾乎所有有害生物如真菌、細菌、病毒、細菌、線蟲、昆蟲、雜草等，有的僅是其中幾類有害生物，該類實驗室應根據所檢測產品上的主要有害生物種類情況參照上述各類有害生物檢疫重點實驗室的要求進行有選擇的配置。